中大研究 | 開創兒童宏基因組組裝基因組數據庫,促進生命早期微生物群研究
  • 2025-01-02 15:46

研究團隊成員包括(左起):張琳博士教授、黃秀娟教授、黃世萬博士、彭也博士

香港中文大學(中大)醫學院的研究團隊,成功開創兒童宏基因組組裝基因組數據庫(Metagenome-Assembled Genome Inventory for Children,MAGIC)。

此一開創性的的數據庫,有助了解生命早期腸道微生物群的發展變化,探索腸道微生物群與人類健康錯綜複雜的相互關係 - 這種關係自人類嬰兒階段開始就已產生。團隊建立的 MAGIC 數據庫,將為全球生命早期微生物組研究奠定堅實的基礎。是次研究結果已於國際期刊《Cell Host & Microbe》發表。

研究背景

生命早期的腸道微生物群,對於免疫和代謝功能的發展至關重要。然而,目前的微生物群資料庫主要以成人序列為基礎,且絕大部分來自西方人群,局限了人們對嬰兒微生物發育及其如何影響健康狀況的理解。

是次研究的高級作者、中大醫學院賽馬會公共衞生及基層醫療學院副教授及香港微生物菌群創新中心(MagIC)副總監黃世萬博士表示:「全面了解生命早期微生物群,對於促進長期健康至關重要。我們的 MAGIC 數據庫通過改善年齡和地域代表性,為推動微生物群基礎科學以及利用微生物群靶向療法促進健康的臨床研究,帶來新的希望。」

研究成果

MAGIC 數據庫從 87 項研究中,搜集了年齡介乎 0 至 7 歲兒童的 20,172 個腸道宏基因組,其中包括來自中大醫學院 2019 年開始建立的「三歲定八十」出生隊列的 613 個宏基因組(相關報導),擴大了地域多樣性。該數據庫包含 3,299 個原核基因組和 139,624 個病毒基因組。

是次研究的主要作者、中大醫學院賽馬會公共衞生及基層醫療學院博士後研究員彭也博士表示:「值得關注的是,8.5% 的原核基因組和 63.9% 的病毒基因組為我們 MAGIC 數據庫所獨有。這些新序列能夠更精準地分析生命早期微生物群。我們的研究也確定了 54 個與兒童健康相關的微生物群體關鍵物種,這些物種亦與地域及年齡相關因素有關。」

研究的通訊作者之一、中大醫學院麻醉及深切治療學系助理教授、香港微生物菌群創新中心首席科學家張琳博士補充:「目前全球對母嬰腸道微生物的認知,主要來自歐美出生隊列研究。MAGIC 數據庫首次納入以中國人群為基礎的『三歲定八十』基因組數據,將使中國在國際生命早期微生物組研究的世界版圖佔一席之位。」

推動嬰兒個人化治療

另一位高級作者、中大醫學院裘槎醫學科學教授、香港微生物菌群創新中心總監、新基石研究員黃秀娟教授表示:「中大醫學院團隊識別嬰兒健康和疾病發展的作用關鍵微生物物種,爲在生命早期預防過敏等疾病的『從 0 到 1』突破奠定了基礎。」

中大表示,MAGIC 數據庫是推動嬰兒個人化治療的重要資源,因此,生命早期微生物介入對於促進終身健康尤其重要。團隊期望這次發現將啟發更多人進一步研究生命早期腸道微生物群對健康和疾病的影響,制定出嶄新的疾病預防和促進健康策略。

是次研究由香港研究資助局及香港特別行政區政府 InnoHK 資助。

 

來源:香港中文大學

 


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