(上圖左起)鄭超固博士、崔學寧博士、王欣茹博士、阮永怡博士
香港大學發現,真核細胞即使在演化過程中失去一種表觀遺傳機制,仍能有效控制基因活性,另一套替代機制會接手運作。這一發現,將有助進一步闡明癌症、神經系統疾病、自體免疫疾病等大規模基因失調所引發的疾病病理機制。相關研究成果已刊《自然 - 通訊》。
論文:
研究背景
除了 DNA 序列所提供的遺傳藍圖外,基因表現亦受到表觀遺傳機制的調控,即在不改變遺傳密碼的情況下,調節基因啟動的時間與方式。正因此,不同類型的細胞才能共享相同的 DNA 藍圖而展現出截然不同的功能與特性。細胞常見的基因調控方式之一是 DNA 甲基化,即在 DNA 上的特定鹼基胞嘧啶(Cytosine)上加上甲基標記,形成 5- 甲基胞嘧啶(5mC),以標示某些基因應維持關閉狀態。
然而,5mC 雖是多種動植物中重要的表觀遺傳標記,但包括秀麗隱桿線蟲在內的一些生物,卻多次在演化過程中失去 DNA 甲基化系統。長久以來,科學界一直未能完全理解這些生物如何有效調控基因表現。
研究成果
港大生物科學學院副教授阮永怡博士、鄭超固博士領導的團隊,證實當 DNA甲基化不存在時,細胞可轉而使用另一套表觀遺傳調控機制。此時,細胞不再依賴 DNA 本身的化學標記,而是透過調節組蛋白上的不同調控訊號,影響相關基因的啟動與關閉。
團隊研究了一種名為 MBD-2(甲基 -CpG 結合結構域蛋白 2)的蛋白。在許多動物中,MBD-2 可辨識帶有 5mC 標記的 DNA,並參與基因表現的抑制或啟動。儘管秀麗隱桿線蟲缺乏 DNA 甲基化,且其 MBD-2 缺乏甲基 -CpG 結合結構域,但其 MBD-2 仍然在基因調控中扮演不可或缺的角色,即使已不再負責解讀 DNA 甲基化訊號,但仍參與核小體重塑和去乙酰化酶(NuRD 複合體)的基因活化,另一方面則與抑制性組蛋白標記(尤其是 H3K27me3)共同作用,參與基因靜默的調控。

左:在哺乳動物中,先前的研究表明大多數 MBD3 的結合位點與 MBD2 和 NuRD 複合物重疊,而 MBD2 也另外獨立佔據富含 DNA 甲基化(5mC)的其他區域;
右:在缺乏 DNA 甲基化的秀麗隱桿線蟲中,MBD-2(Cel-MBD-2)儘管缺乏甲基結合域,仍表現出與哺乳動物 MBD2 類似的雙重結合模式,大多數的 Cel-MBD-2 獨立於 NuRD,並結合到富含抑制性組蛋白修飾(如 H3K27me3 和 H3K9me2/3)的基因組區域
當 MBD-2 缺失,線蟲會失去生殖能力,並出現嚴重的身體缺陷;大量基因亦無法被正常調控。
本研究顯示,真核生物的表觀遺傳調控具有高度適應性,即使部分基因調控系統在演化中消失,生物仍能透過替代訊號,維持基因表現的精確控制。
團隊表示,此研究有助深入理解癌症、自閉症及炎症等疾病的成因。這些疾病往往涉及異常的 DNA 甲基化,導致多個基因同時失調。
研究團隊
論文第一作者是崔學寧博士,通訊作者是阮永怡博士。此外,鄭超固博士、王欣茹博士亦是共同作者。崔學寧博士是鄭超固博士的實驗室成員,王欣茹博士是阮永怡博士實驗室成員。
來源:香港大學
如欲知道更多教科相關消息,請留意京港 Facebook 專頁:https://www.facebook.com/BHKAEC